菌落總數是指示性微生物指標，用以反映食品的衛生狀況。食品的菌落總數超標，會破壞食品的營養成分，加速食品的腐敗變質。《食品安全國家標準 蜜餞》（GB 14884—2016）中規定水果制品檢測菌落總數時應采集同批次5個樣品進行檢測，5個樣品檢測結果最高值不得超過104 CFU/g，且超過103 CFU/g的樣品數量不得超過2個。造成菌落總數不合格的原因可能是生產企業所使用的原輔料初始菌落總數較高，殺菌工藝未達到要求導致；也可能是生產加工過程中衛生條件控制不嚴格所致；還有可能與產品包裝密封不嚴、儲運條件控制不當有關。

    近期，黑龍江省市場監督管理局發布了關于9批次食品不合格情況的通告（2022年第12期）。

    其中，大興安嶺地區加格達奇區雨欣家山珍土特產店銷售的標稱大興安嶺綠源蜂業有限公司生產的藍莓果糕（生產日期：2021年9月2日，150克/袋，蜜司令+字母商標），菌落總數不符合食品安全國家標準規定，檢驗結果為8.2×10?,9.5×10?,8.4×10?,8.7×10?,8.8×10? CFU/g，標準值為n=5,c=2,m=10?,M=10? CFU/g。

    據行政處罰決定書文號：加市監處字﹝2021﹞92號，大興安嶺綠源蜂業有限公司因銷售不符合食品安全國家標準的食品，被沒收不符合國家食品安全標準的食品蜜司令藍莓果糕50袋（150克/袋），沒收違法所得人民幣275元并罰款5萬元。

    菌落總數超標說明該產品的衛生可能有問題。據悉，菌落總數測定是用來判定食品被細菌污染的程度及衛生質量，如果菌落總數超標嚴重，將會破壞食品的營養成分，加速食品的腐敗變質。消費者食用微生物超標嚴重的食品，很容易患痢疾等腸道疾病，可能引起嘔吐、腹瀉等癥狀，危害人體健康安全。

    山東萊恩德智能科技有限公司生產的LD-ATP熒光檢測儀基于螢火蟲發光原理，利用“熒光素酶—熒光素體系”研制而成；由于所有生物活細胞中含有恒量的ATP，所以ATP含量可以清晰地表明樣品中微生物與其他生物殘余的多少，深芬儀器ATP熒光檢測儀適用于食品、飲用水中微生物快速檢測，餐具潔凈度快速檢測，食品加工器具、工作臺面、餐飲器具等消毒結果快速檢測，醫療環境工作平臺即時評估。該設備采用生物化學反應方法檢測ATP菌落總數含量。